Команды разбиты на две корзины: 12 победителей групп и 4 лучших клуба, финишировавших третьими на групповом этапе Лиги чемпионов, получат статус сеяных.
Сеяные будут сведены в парах с 12 обладателями вторых мест и оставшимися 4 клубами, финишировавшими третьими на групповом этапе ЛЧ. Сеяные команды ответный матч проводят дома.
Клубы, игравшие в одной группе или представляющие одну национальную ассоциацию, разводятся по разным парам.
Сеяные: "Арсенал" (Англия), "Айнтрахт" (Германия), "Байер" (Германия), "Бенфика" (Португалия), "Бетис" (Испания), "Валенсия" (Испания), "Вильярреал" (Испания), "Генк" (Бельгия), "Динамо" (Загреб, Хорватия), "Динамо" (Киев, Украина), "Ред Булл Зальцбург" (Австрия), "Зенит" (Россия), "Интер" (Италия), "Наполи" (Италия), "Севилья" (Испания), "Челси" (Англия).
Несеяные: БАТЭ (Беларусь), "Брюгге" (Бельгия), "Виктория" Пльзень (Чехия), "Галатасарай" (Турция), "Краснодар" (Россия), "Лацио" (Италия), "Мальме" (Швеция), "Олимпиакос" (Греция), "Рапид" (Вена, Австрия), "Ренн" (Франция), "Селтик" (Шотландия), "Славия" (Чехия), "Спортинг" (Португалия), "Фенербахче" (Турция), "Цюрих" (Швейцария), "Шахтер" (Украина)
Первые матчи 1/16 финала Лиги Европы пройдут 14 февраля, ответные – 21 февраля.